医院始建于1976年，1981年正式开诊, 是省卫健委审批、市卫健委直属的三级妇幼保健院，也是首批卫生部评审通过的国家级爱婴医院。

2017年6月市妇幼保健所、市计划生育宣传指导站与市妇幼保健院资源整合为“淮北市妇幼保健计划生育服务中心（淮北市妇幼保健院）”，同时加挂“淮北市儿童医院”、“淮北市第二人民医院”牌子，是目前安徽省规模领先、皖北规模最大的妇幼保健专科服务机构。

是淮北市城镇职工、居民医疗保险定点医院、职工工伤和生育保险定点医院、淮北市三区一县新型农村合作医疗定点医院及淮北市老干部保健定点医院。2016年经市卫生计生委同意淮北市儿科质控中心、产科质控中心、病理质控中心、淮北市产前筛查和产前诊断质控中心挂靠单位。

医院经过逐年发展现设有孕产保健部（包含孕期保健科、产科病区、产房）、儿童保健部（包含儿童保健科、儿科病区、新生儿科）、妇女保健科（包含妇女保健科、妇科病区）、计划生育服务部四个保健部门，以及内科、外科、超声中心、检验科、口腔科、五官科、麻醉科、皮肤科等26个临床医技科室。医院诊疗设备先进，拥有美国GE E8四维彩超2台、16排CT、9台彩色超声多普勒诊断仪、高频乳腺X射线机、全自动化生化分析仪、化学发光仪、血液分析仪、微量元素检测设备、病理检验设备、宫腹腔镜、阴道镜、肺功能脑干诱发电位仪、MP妊高症检测仪、新生儿呼吸机、新生儿转运系统、盆底诊疗仪、中药熏蒸舱、乳腺治疗仪等国内外一流的医疗设备。

目前，淮北市妇幼保健院已进入“大保健”服务模式，在“临床与保健相结合”的整体发展框架下，以“四大部”为依托，以保健为中心，以保障生殖健康为目的，保健与临床相结合，面向群体、面向基层和预防为主，皖北领先的妇幼保健专业机构。